《谢谢青木关》以男孩章诗宁的日记形式，讲述了抗战爆发后，诗宁和妈妈妹妹，在日本飞机的轰炸中，一路逃难。在过一座木桥时，可怕的“膏药飞机”再次露出了狰狞的面目。木桥断了，妹妹不幸坠河，连受惊吓的诗宁加上悲痛，患上了心理疾病，原本是学校合唱队领唱的他甚至连声音都发不出了。在青山绿水的青木关，诗宁认识了许多质朴的朋友，感受着暂时的宁静，更在一座“音乐山”里，找到了治愈内心创伤的动人音乐。终于，诗宁的歌声回来了……